九疑山瑤族鄉位于寧遠縣南部，東西長約25公里，南北寬約45公里。東與藍山縣的紫良鄉相接，南與江華、道縣相鄰。總面積328.3平方公里，其中稻田890公頃，占總面積的3.2%，人均稻田0.034公頃，山地有林面積為14507.07公頃，占總面積的47%。鄉政府駐地九疑山村距縣城32公里。轄31個行政村，266個村民小組，人口30739人，有少數民族5515人，其中瑤族5497人，苗族1人，壯族9人，布依族6人，侗族2人。九嶷山瑤族鄉沿用原駐地名，境內原屬灣井區，1995年撤區并鄉建鎮時由原來的九嶷山瑤族鄉、魯觀瑤族鄉和麥地鄉合并建立九嶷山瑤族鄉。