托克遜位于新疆維吾爾自治區(qū)中東部，天山南麓，吐魯番盆地西部。北緯41°21′14〞-43°18′11〞，東經87°14′05〞-89°11′08〞。東與吐魯番市為鄰，南與巴州尉犁縣相接，西與巴州的和碩、和靜縣相連，北與烏魯木齊市毗鄰。縣城托克遜鎮(zhèn)距烏魯木齊市公路里程162千米。托克遜縣轄鎮(zhèn)，縣府駐地。面積14平方公里，人口1.5萬。有維吾爾、漢、回等民族，其中維吾爾族占44.8%。轄5個居委會（按序數命名）。