菏澤市牡丹區南城辦事處位于菏澤市區南部，東鄰東城辦事處、開發區丹陽辦事處，南接開發區佃戶屯辦事處、何樓辦事處，西與西城辦事處接壤，北與北城辦事處毗鄰，兗新鐵路橫貫東西，辦事處駐地在解放大街398號。全處總面積12.5平方公里，南北最長距離4560米，東西最寬距離3200米，耕地面積933畝。南城辦事處1983年前隸屬原菏澤縣城關鎮，1983年12月城關鎮解體，另設5個城區辦事處，分別為東城、西城、南城、北城、丹陽五個辦事處，遂設菏澤市（縣級）南城辦事處，現為牡丹區南城辦事處。南城辦事處轄1個社區管委會、14個社區，21個自然村。一個社區管委會—朝陽社區管理委員會；14個社區—雙井社區、雙陽社區（包括武莊、馬莊、張莊、何莊4個自然村）、程堤口社區、馬堤口社區、侯店社區、黃口社區（包括東口、中口、西口3個自然村）、張樓社區 （包括柴莊、張樓2個自然村）、郭大千社區（包括田口、郭大千2個自然村）、曹州社區、新興社區 、中山社區、中岳社區、中意社區、中和社區 。